Gephi 中文教程

介绍Gephi的基本使用方法,有大量实际操作的视频演示,便于初学者快速入门。
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such as the number of ratings, the age of ratings, and the
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  • Lectures 24
  • Contents Video: 2 hours
    Other: 8 mins
  • Skill Level Intermediate Level
  • Languages Simplified Chinese
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About This Course

Published 2/2012 Simplified Chinese

Course Description

Gephi 是一款网络分析领域的数据可视化处理软件,开发者对它寄予的希望是:成为 “数据可视化领域的Photoshop” 。

为推动 Gephi 在中文领域的发展,分享实验室  以MOOC模式在  udemy.com  推出了Gephi中文视频教程。Gephi中文教程介绍了Gephi是什么样的软件,提供什么样的功能,各项主要功能的操作方式等等。 

Gephi中文教程采用  CC BY-NC 3.0  版权的协议发布。

关于此 Gephi 中文教程如果您有任何问题或建议,可以通过电子邮件( digitip#gmail.com )与讲者取得联系,也可以在一些社交网络比如推特微博等查找 @ooof 获取他的更多消息。 

What are the requirements?

  • 它很容易的,有一点耐心可以
  • 熟悉 Excel 和 csv 更好

What am I going to get from this course?

  • 理解 Gephi 处理的基本过程
  • 知道如何收集必要的数据
  • 独立完成可视化图形的制作

What is the target audience?

  • 新闻系学生
  • 工程技术人员
  • 媒体研究者
  • 希望进入数据可视化领域的程序员

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Curriculum

Section 1: Gephi 简介
06:36

本节内容:

1.介绍 Gephi 是干什么的?

2.Gephi 图形是什么样子?

3.构成 Gephi 图形的基础

本节要点:

1.理解 Gephi 图形是如何构成的。

本节建议:

1. 如果还未接触,建议开始了解一些图论的知识。

可选作业:

1. 对于本节视频,有什么问题或想法,请发邮件到: digitip@gmail.com

07:21

本节内容:

1.欢迎窗口;

2.用户界面;

3.基本操作流程。

本节要点:

1.理解Gephi 的基本操作流程

技能延伸:

1.欢迎窗口可以在使用中随时打开,试着找找;欢迎窗口也可以通过自定义的快捷键快速打开,也试着看看怎么做?

可选作业:

1. 对于本节视频,有什么问题或想法,请发邮件到: digitip@gmail.com

Section 2: 数据输入
08:44

本节内容:

介绍以下五种数据进入 Gephi 的方式

1.鼠标点;2.键盘输;3.CSV格式文本;4.其它格式文件;5.程序生成

本节要点:

1.了解数据进入 Gephi 的方式。

可选作业:

1. 如果你已经尝试着输入了任何图形,欢迎发过来;对于这五种方式,有什么问题或想法,请发邮件到: digitip@gmail.com

小提示:

浏览视频时,请点击视频右下方的全屏按钮,以达最佳视频效果。

04:03

本节内容:

介绍以下三种数据进入 Gephi 的方式

1.导入数据库数据;2.浏览网站获取数据( 请注意:此方式用到的插件不支持目前新版本的 Gephi  );3.Gmail账户获取数据。

延伸阅读:

通过数据库获取数据的一个完整实践:http://gabesawhney.com/?p=85

浏览网站获取数据的另外一个例子: http://v.youku.com/v_show/id_XMjU5MDcwMTk2.html

可选作业:

1. 如果你已经尝试着输入了任何图形,欢迎发过来;对于这三种方式,有什么问题或想法,请发邮件到: digitip@gmail.com

小提示:

浏览视频时,请点击视频右下方的全屏按钮,以达最佳视频效果。

05:23

本节内容:

在用鼠标点创建节点和连线的过程中,如何设置节点的大小和颜色,如何设置连线的颜色和权重。

小提示:

浏览视频时,请点击视频右下方的全屏按钮,以达最佳视频效果。

作业:

1. 画一些包括节点和连线的图形,发送到:digitip@gmail.com 。

03:57

本节内容:

这节视频通过说明三个问题的方式,介绍 CSV 是什么?如何得到 CSV ?以及 Gephi 中使用 CSV 的一些要点。

小提示:

目前的 Gephi 中文版在导出 CSV 的边(Edges)数据时,第一行会使用“源,目标,类型”三个中文字符;这会造成,在导入时,因为无法在第一行找到“Source,Target,Type”而使导入无法进行;把 CSV 中的标题分别改为“Source,Target,Type”可解决此问题。

延伸阅读 ( 关于 CSV 更全面的知识可以访问以下网址获得) 

维基百科中的 CSV 页面: http://en.wikipedia.org/wiki/Comma-separated_values

维基百科中的 CSV 中文页面:http://zh.wikipedia.org/wiki/%E9%80%97%E5%8F%B7%E5%88%86%E9%9A%94%E5%80%BC

CSV 标准 RFC 4180 :http://tools.ietf.org/html/rfc4180

08:46

本节内容:

以《西游记》中的爱慕关系为线索手动创建一个 CSV 文件,并导入 Gephi ;附带两个小甜饼:1.在 Gephi 中使用中文;2.《西游记》人物爱慕关系的快速可视化。


作业:

1. 你会想到从一些什么地方收集有趣的信息,欢迎发送到:digitip@gmail.com ;

三个附件的下载地址: http://www.udemy.com/lectures/csv-85430  ;包括以下内容:

1.西游记爱慕关系图 Gephi 文件;
2.西游记爱慕关系图 CSV 文件;
3.西游记爱慕关系图 PNG 文件。

04:28

本节内容:

这节视频会介绍程序自动生成数据的方法,生成的数据包括静态数据和动态数据,并会演示动态数据的显示方式。

兴趣小组:

在制作这节视频的时候 @ooof 冒出一个念头:也许可以用 Gephi 动态数据的方式,制作一个呈现世界或中国历史中,人物、重大事件、科技进步成果或某个其它专题的或者混搭的一个时间流图,或者你有其它制作时间流图的想法,欢迎有兴趣的学习者发邮件到 digitip@gmail.com , @ooof 也会把有关的更多想法告诉你。

Section 3: 图形编辑处理
12:33

本节内容:

这段视频主要介绍图窗体内编辑节点和边的几个基本工具。

04:17

本节内容:

这段视频概括介绍 Gephi 五个高级编辑工具在界面中的位置、具有的功能、在使用上相互间的关系,以及在 Gephi 中文教程中介绍的顺序。

06:22

本节内容:

这节视频介绍 Gephi 编辑工具中排序的操作方法,排序是数据可视化操作中一种常用的方式,具体介绍了节点颜色、节点大小、节点标签颜色、节点标签大小的排序方法。

10:37

本节内容:

1.布局操作界面简介;

2.Gephi 默认安装12个布局的简要的介绍;

3.用一组数据做几个布局实际的演示。

本节要点:

1.了解 Gephi 布局的操作方法,知道布局样式的基本效果。

关于布局(Layout)名称的说明:

Layout 是 Gephi 中一个主要的编辑工具,在 Gephi.0.8.1 beta 的中文界面翻译为“流程”。

Layout 在词典中有“安排;设计;布局”的意思;

Gephi 插件开发者 @杜一 建议翻译成“布局”比较合适,意思是把节点和边摆放到特点的位置。

@ooof 觉得“布局”这个词能够比较形象的表达 Layout 这个操作的实际作用,并且与其它几个编辑工具(排序、分割、统计、过滤)有一种比较类似的动作特性。因此,@ooof 决定在这节视频中,采用“布局”这个词来代替原来的“流程”。

为使各位学习者知晓情形,特此说明。

@杜一 关于布局的更多分享:

需要提的一点是,布局算法非常多,Gephi 只是提供了一些默认的实现,完全可以利用提供的API 自己实现新的布局算法。因此,布局的详细内容,还是需要学习者自己去深入研究,无需作为Gephi入门介绍的重点。

对于layout 的介绍, http://www.slideshare.net/gephi/gephi-tutorial-layouts 这个ppt作为入门介绍比较合适。在其中,关于yifan hu 的介绍有两页,简单看一下,这个算法算是改进的Force directed 算法,它通过将图的粒度变粗这样一种分层的方法,来降低Force directed 算法的运算量,提高布局的速度;另一个改进,是算法可以自动停止,这是传统的force directed 算法没有做到的。进一步研究,可以参考该页下面提到的参考文献。

可选作业:

1. 对于本节视频,有什么问题或想法,请发邮件到: digitip@gmail.com

10:00
本节内容: 1.介绍统计的操作界面; 2.了解统计运行的原理。 我们创建了 Gephi中文教程 G+ 信息页,欢迎加圈:https://plus.google.com/u/0/b/105972204587241689146/
10:17

本节内容:

这节视频介绍分割,内容包括:分割简介;分割的数据来源;通过统计生成分割数据,并用此数据做更改节点颜色以及组合节点的操作;手动输入数据,做一个“给一堆豆子分组”的练习。

Gephi 中文教程 G+ 信息页: https://plus.google.com/u/0/b/105972204587241689146/

09:20

本节内容:

这节视频介绍过滤,内容包括:过滤的作用;过滤的操作界面,过滤的使用方式;在介绍过滤的使用方式中,会做两个小练习:1.通过一个 ID 找到一个节点;2.通过正则表达式找到一些节点。

延伸阅读:

关于正则表达式: http://zh.wikipedia.org/wiki/%E6%AD%A3%E5%88%99%E8%A1%A8%E8%BE%BE%E5%BC%8F 

联系我们:

Gephi 中文教程 G+ 信息页地址: https://plus.google.com/u/0/b/105972204587241689146/

中文网志大学:https://plus.google.com/109054790672076236049/posts/eNyeyCJBRSZ

@讲者: 新浪微博  , Twiter  

Section 4: 图像输出控制
07:56

这节视频介绍预览,内容包括:预览的简介,预览区和预览设置区的操作。

与 Gephi 中文教程相关的任何问题,也可以通过以下方式与我们交流 :

G+ 地址: https://plus.google.com/u/0/b/105972204587241689146/

新浪微博:http://weibo.com/ooof

腾讯微博:http://t.qq.com/ooof

电子邮件:digitip@gmail.com

Section 5: 实例演示
08:41

这节视频介绍一个完整的例子:会导入四个 Twitter 用户的好友及粉丝,编辑处理,并生成一幅呈现四个用户好友及粉丝间错综复杂的关系图。

与 Gephi 中文教程相关的任何问题,也可以通过以下方式与我们交流 :

G+ 地址: https://plus.google.com/u/0/b/105972204587241689146/

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腾讯微博:http://t.qq.com/ooof

电子邮件:digitip@gmail.com

Section 6: 致谢
Article
各位 Gephi 中文教程的学习者: 感谢你们陪同 Gephi 中文教程走过了这一段不算太长但也不短的时光。 Gephi 中文教程能这样一路走下来也有赖于很多人的帮助。 首先是  IsaacMao   ,他是一个有远见、宏观又对细节有深刻思考的人,是他早在2011年4月,在推上提示我可以去了解一下 Gephi ,才使我开始了对这个有趣应用的探索,也开始了对数据可视化的关注,先是一阵搜索,开始学习后又做了一些图,也才发现 IsaacMao 其实在更早的时候就关注上 Gephi 了,IsaacMao 也在 Google 阅读中(现在是 G+ ),分享过 Gephi 在一些事物/事件上的应用。 也要…
Section 7: 更多的......
03:30

本节内容:

这是一节扩展的视频,介绍 Gephi 工具中等级的使用方法,等级是一种呈现,可以把嵌套的组合以树状图的形式呈现出来。

97.2 kB

包括有以下内容:

1.西游记爱慕关系 Gephi 文件;
2.西游记爱慕关系 CSV 文件;
3.西游记爱慕关系完成 PNG 图。

12.1 kB

下载后,不用解压,直接把扩展名改为 .gephi ;

用 Gephi 打开即可食用。  :)

祝各位学习者节日快乐 !

540.2 kB

附件是为回复 @Ran Qi 在 Gephi中文教程(11)布局 中提到的,关于建立多维数据问题而整理的一些文件,感兴趣的学习者也可以下载了解,文件包括以下内容:

cancer.csv ,是原始数据,我加上了中文的用户名,导入数据的处理请看 导入节点数据第一/二步.png;

cancer.gephi ,是导入原始数据,并处理后的文件,你打开以后需要选择中文字体,中文才能显现;

cancer.png ,是在 Gephi 中处理后对图像截的屏幕;

癌症病人模拟数据说明.txt ,这个文件包文件的说明;

导入节点数据第一/二步.png ,是两个导入 CSV 文件时需要注意一下的。

=====

新版 Udemy 对回复的编辑支持有些简单,就多在这里发一份吧。  

我试着把你前面给的数据录入 CSV ,并导入 Gephi 处理了一下,一并生成的几个文件也发到 http://www.udemy.com/lectures/-97118 ,请查看。

关于多维数据,就我的理解,在同一个时间,Gephi 只能给一个节点赋予二维的数据(大小和颜色)。比如在 cancer.gephi 和 cancer.png 图中,节点的颜色来自 nodes 的值,节点的大小来自 grade 的值。


PS:抱歉,写完后,才想到,其实 Gephi 还有一些数据维度的支持:1.Gephi 支持时间轴,如果一个患者的数据有时间特性的话,可以添加时间的特性;2.Gephi 也可以对节点提供经纬度坐标的支持,也许有用。

另外还可以用一个变通的方式,提供对多维数据的支持,比如,就某一个数值,可以把数值相同的节点用一条线连起来;或者让他们指向一个特定的节点(或相反方向)来标识他们数据间的差异。这样,结合布局,有可能会形成你希望出现的簇效果。 :)

也许你可以继续试验一下。


希望是有帮助的。

Gephi 中文教程-练习数据
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查看链接: http://social-dynamics.org/?p=311

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Instructor Biography

Ooof liu, Network administrator , Blog

Liu Yong is the founder and organizer of Linfen Internet Application Promotion Project .He was appointed the Director of Communication for NGO2.0 China Project and serves as the deputy director of the NGO2.0 Technology Team sponsored by the Project.

He is also one of the earliest bloggers in China. He has worked as a volunteer for CNBlog's annual conventions and was a participant of the Digital Nomad Project for Independent Blog. Between 1998 and 2004, Liu developed several Web applications, some of which resembled the Twitter application.

Liu is a strong believer of Web 2.0. He has set up an independent blog and is an active user of Twitter (@ooof) .

Sharing laboratory members .

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