Gephi 中文教程

本节内容：

介绍以下五种数据进入 Gephi 的方式

1.鼠标点；2.键盘输；3.CSV格式文本；4.其它格式文件；5.程序生成

本节要点：

1.了解数据进入 Gephi 的方式。

可选作业：

1. 如果你已经尝试着输入了任何图形，欢迎发过来；对于这五种方式，有什么问题或想法，请发邮件到： digitip@gmail.com

小提示：

浏览视频时，请点击视频右下方的全屏按钮，以达最佳视频效果。

本节内容：

在用鼠标点创建节点和连线的过程中，如何设置节点的大小和颜色，如何设置连线的颜色和权重。

小提示：

浏览视频时，请点击视频右下方的全屏按钮，以达最佳视频效果。

作业：

1. 画一些包括节点和连线的图形，发送到：digitip@gmail.com 。

本节内容:

这节视频通过说明三个问题的方式，介绍 CSV 是什么？如何得到 CSV ？以及 Gephi 中使用 CSV 的一些要点。

小提示：

目前的 Gephi 中文版在导出 CSV 的边（Edges）数据时，第一行会使用“源,目标,类型”三个中文字符；这会造成，在导入时，因为无法在第一行找到“Source,Target,Type”而使导入无法进行；把 CSV 中的标题分别改为“Source,Target,Type”可解决此问题。

延伸阅读 ( 关于 CSV 更全面的知识可以访问以下网址获得) ：

维基百科中的 CSV 页面： http://en.wikipedia.org/wiki/Comma-separated_values

维基百科中的 CSV 中文页面：http://zh.wikipedia.org/wiki/%E9%80%97%E5%8F%B7%E5%88%86%E9%9A%94%E5%80%BC

CSV 标准 RFC 4180 ：http://tools.ietf.org/html/rfc4180

本节内容：

以《西游记》中的爱慕关系为线索手动创建一个 CSV 文件，并导入 Gephi ；附带两个小甜饼：1.在 Gephi 中使用中文；2.《西游记》人物爱慕关系的快速可视化。

作业：

1. 你会想到从一些什么地方收集有趣的信息，欢迎发送到：digitip@gmail.com ；

三个附件的下载地址： http://www.udemy.com/lectures/csv-85430  ；包括以下内容：

1.西游记爱慕关系图 Gephi 文件；
2.西游记爱慕关系图 CSV 文件；
3.西游记爱慕关系图 PNG 文件。

本节内容：

这节视频会介绍程序自动生成数据的方法，生成的数据包括静态数据和动态数据，并会演示动态数据的显示方式。

兴趣小组：

在制作这节视频的时候 @ooof 冒出一个念头：也许可以用 Gephi 动态数据的方式，制作一个呈现世界或中国历史中，人物、重大事件、科技进步成果或某个其它专题的或者混搭的一个时间流图，或者你有其它制作时间流图的想法，欢迎有兴趣的学习者发邮件到 digitip@gmail.com ， @ooof 也会把有关的更多想法告诉你。

本节内容：

这段视频主要介绍图窗体内编辑节点和边的几个基本工具。

本节内容：

这段视频概括介绍 Gephi 五个高级编辑工具在界面中的位置、具有的功能、在使用上相互间的关系，以及在 Gephi 中文教程中介绍的顺序。

本节内容：

这节视频介绍 Gephi 编辑工具中排序的操作方法，排序是数据可视化操作中一种常用的方式，具体介绍了节点颜色、节点大小、节点标签颜色、节点标签大小的排序方法。

本节内容：

1.布局操作界面简介；

2.Gephi 默认安装12个布局的简要的介绍；

3.用一组数据做几个布局实际的演示。

本节要点：

1.了解 Gephi 布局的操作方法，知道布局样式的基本效果。

关于布局(Layout)名称的说明：

Layout 是 Gephi 中一个主要的编辑工具，在 Gephi.0.8.1 beta 的中文界面翻译为“流程”。

Layout 在词典中有“安排；设计；布局”的意思；

Gephi 插件开发者 @杜一 建议翻译成“布局”比较合适，意思是把节点和边摆放到特点的位置。

@ooof 觉得“布局”这个词能够比较形象的表达 Layout 这个操作的实际作用，并且与其它几个编辑工具（排序、分割、统计、过滤）有一种比较类似的动作特性。因此，@ooof 决定在这节视频中，采用“布局”这个词来代替原来的“流程”。

为使各位学习者知晓情形，特此说明。

@杜一 关于布局的更多分享：

需要提的一点是，布局算法非常多，Gephi 只是提供了一些默认的实现，完全可以利用提供的API 自己实现新的布局算法。因此，布局的详细内容，还是需要学习者自己去深入研究，无需作为Gephi入门介绍的重点。

对于layout 的介绍， http://www.slideshare.net/gephi/gephi-tutorial-layouts 这个ppt作为入门介绍比较合适。在其中，关于yifan hu 的介绍有两页，简单看一下，这个算法算是改进的Force directed 算法,它通过将图的粒度变粗这样一种分层的方法，来降低Force directed 算法的运算量，提高布局的速度；另一个改进，是算法可以自动停止，这是传统的force directed 算法没有做到的。进一步研究，可以参考该页下面提到的参考文献。

可选作业：

1. 对于本节视频，有什么问题或想法，请发邮件到： digitip@gmail.com

本节内容：

这节视频介绍分割，内容包括：分割简介；分割的数据来源；通过统计生成分割数据，并用此数据做更改节点颜色以及组合节点的操作；手动输入数据，做一个“给一堆豆子分组”的练习。

Gephi 中文教程 G+ 信息页： https://plus.google.com/u/0/b/105972204587241689146/

本节内容：

这节视频介绍过滤，内容包括：过滤的作用；过滤的操作界面，过滤的使用方式；在介绍过滤的使用方式中，会做两个小练习：1.通过一个 ID 找到一个节点；2.通过正则表达式找到一些节点。

延伸阅读：

关于正则表达式： http://zh.wikipedia.org/wiki/%E6%AD%A3%E5%88%99%E8%A1%A8%E8%BE%BE%E5%BC%8F 

联系我们：

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中文网志大学：https://plus.google.com/109054790672076236049/posts/eNyeyCJBRSZ

@讲者： 新浪微博  ， Twiter  

这节视频介绍预览，内容包括：预览的简介，预览区和预览设置区的操作。

与 Gephi 中文教程相关的任何问题，也可以通过以下方式与我们交流 ：

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电子邮件：digitip@gmail.com

这节视频介绍一个完整的例子：会导入四个 Twitter 用户的好友及粉丝，编辑处理，并生成一幅呈现四个用户好友及粉丝间错综复杂的关系图。

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本节内容：

这是一节扩展的视频，介绍 Gephi 工具中等级的使用方法，等级是一种呈现，可以把嵌套的组合以树状图的形式呈现出来。

包括有以下内容：

1.西游记爱慕关系 Gephi 文件；
2.西游记爱慕关系 CSV 文件；
3.西游记爱慕关系完成 PNG 图。

下载后，不用解压，直接把扩展名改为 .gephi ；

用 Gephi 打开即可食用。  :)

祝各位学习者节日快乐 ！

附件是为回复 @Ran Qi 在 Gephi中文教程(11)布局 中提到的，关于建立多维数据问题而整理的一些文件，感兴趣的学习者也可以下载了解，文件包括以下内容：

cancer.csv ，是原始数据，我加上了中文的用户名，导入数据的处理请看 导入节点数据第一/二步.png；

cancer.gephi ，是导入原始数据，并处理后的文件，你打开以后需要选择中文字体，中文才能显现；

cancer.png ，是在 Gephi 中处理后对图像截的屏幕；

癌症病人模拟数据说明.txt ，这个文件包文件的说明；

导入节点数据第一/二步.png ，是两个导入 CSV 文件时需要注意一下的。

=====

新版 Udemy 对回复的编辑支持有些简单，就多在这里发一份吧。  

我试着把你前面给的数据录入 CSV ，并导入 Gephi 处理了一下，一并生成的几个文件也发到 http://www.udemy.com/lectures/-97118 ，请查看。

关于多维数据，就我的理解，在同一个时间，Gephi 只能给一个节点赋予二维的数据（大小和颜色）。比如在 cancer.gephi 和 cancer.png 图中，节点的颜色来自 nodes 的值，节点的大小来自 grade 的值。

PS：抱歉，写完后，才想到，其实 Gephi 还有一些数据维度的支持：1.Gephi 支持时间轴，如果一个患者的数据有时间特性的话，可以添加时间的特性；2.Gephi 也可以对节点提供经纬度坐标的支持，也许有用。

另外还可以用一个变通的方式，提供对多维数据的支持，比如，就某一个数值，可以把数值相同的节点用一条线连起来；或者让他们指向一个特定的节点（或相反方向）来标识他们数据间的差异。这样，结合布局，有可能会形成你希望出现的簇效果。 :)

也许你可以继续试验一下。

希望是有帮助的。