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Introdução à programação com R para áreas biológicas
Rating: 4.5 out of 5(80 ratings)
340 students

Introdução à programação com R para áreas biológicas

Modele problemas de biologia com a linguagem estatística R
Last updated 6/2022
Portuguese
Portuguese [Auto],

What you'll learn

  • Conceitos básicos da linguagem de programação R
  • Utilizar o ambiente RStudio
  • Conceito de variáveis, condicionais, loops, funções
  • Estruturas de dados do R: vetores, matrizes, listas, dataframes etc
  • Expressões regulares
  • O básico de plotagem gráfica
  • Analisando arquivos csv
  • Criar scripts que facilitam a execução de tarefas, como a plotagem gráfica
  • Identificar padrão em sequências gênicas
  • Modelar um problema de genética de populações
  • Criar funções que geram uma sequência aleatória de DNA
  • Plotar gráficos de acordo com dados de experimentos

Course content

11 sections84 lectures7h 0m total length
  • Introdução ao curso7:55

    O objetivo desta aula é introduzir o curso e o que será estudado

  • Introdução à linguagem R4:05

    O objetivo desta aula é introduzir a linguagem R e onde é usada

  • Instalando o R e o RStudio3:41

    O objetivo desta aula é introduzir o RStudio, ferramenta que usaremos para programar em R

  • Conhecendo o ambiente RStudio6:26

    O objetivo desta aula é introduzir o layout e principais comandos do R Studio

Requirements

  • O básico de lógica de programação é desejável, embora possa ser possível acompanhar o curso uma vez que até mesmo conceitos de lógica de programação são explicados
  • Conhecimentos básicos de biologia a nível de ensino médio são desejáveis

Description

Biólogos e profissionais de áreas relacionadas tradicionalmente não tem muito contato com a programação, ao contrário de áreas como a matemática e a engenharia, onde os alunos costumam ter pelo menos uma noção básica na graduação. Entretanto, com a crescente quantidade de dados biológicos sendo gerados em bancos de dados de sequências gênicas, proteínas, compostos químicos, espécies, e outros, há uma motivação de aliar conhecimentos da biologia com a área da computação. Dentre as tecnologias da computação, a linguagem R tem sido muito usada na área da saúde, ecologia e biologia para processar e realizar análises em grandes conjuntos de dados, possuindo bibliotecas específicas para diversas áreas.

Neste curso introdutório, apresentando os principais conceitos da linguagem R, que é uma das linguagens mais voltadas à área de ciência de dados, como variáveis, inputs do usuário, loops de repetições, estruturas de dados, funções, geração de gráficos e muitos outros!!! Cada capítulo possui, na maioria das vezes, aulas téoricas sobre o assunto a ser trabalhado, seguido do conceito a ser trabalhado no R, seguido por pequenos quizzes para fixar os conhecimentos e exercícios aplicados em um contexto biológico com a finalidade de estimular o aluno a aplicar os conceitos aprendidos em algum problema biológico.


Desta forma, este curso possui:

  1. Mais de 70 vídeo-aulas dentre explicações conceituais, code-along (entendendo os conceitos no código) e resoluções de exercícios

  2. 10 quizzes e um simulado para fixar os conteúdos aprendidos em cada aula,

  3. Mais de 30 exercícios para que você resolva pequenos problemas biológicos com programação, com vídeos de resolução logo em seguida mostrando a solução passo-a-passo

  4. 2 pequenos projetos onde você aplicará a maior parte dos conceitos aprendidos até o momento para fixar ainda mais os conteúdos e vislumbrar possíveis projetos do R nas áreas biológicas

Who this course is for:

  • Pessoas que queiram aprender uma linguagem de programação
  • Pessoas que queiram aprender a utilizar o R em um contexto biológico
  • Pessoas de áreas biológicas que estejam cursando disciplinas de R
  • Pessoas que programam em R curiosas sobre a modelagem de problemas biológicos em R