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Estudios en Ecología y Evolución con ArcGIS 10
Utilizando MaxEnt y SDM Toolbox
Highest Rated
Created byIsis Gómez López
Last updated 8/2021
Spanish
What you'll learn
- Realizar análisis de biodiversidad y ecología, crear modelos de distribución de especies.
Explore related topics
Course content
12 sections • 105 lectures • 6h 31m total length
- Qué vamos a aprender en este curso5:21
Pequeño vídeo introductorio a los contenidos del curso y las características del aula
- ¿Cómo se aprende en este curso? y en cualquier otro3:21
En esta clase conoceremos una información muy valiosa sobre el proceso de aprendizaje, que nos será muy util para realizar este curso
- La importancia de los SIG9:10
Conoceremos a través de ejemplos, como han evolucionado los SIG, algunas nociones básicas y la importancia que tienen hoy en día para la toma de las decisiones territoriales.
- Manual de la unidad 1: Descarga de Ebook0:07
En esta clase encontrarás el manual o ebook de la unidad para su descarga.
- Pero, ¿Qué es realmente un SIG?3:09
En este caso analizaremos varias definiciones sobre que es un SIG y también conoceremos los distintos usos de la palabra SIG en el lenguaje cotidiano.
- Componentes de los SIG4:42
En este caso estudiaremos los componentes de un SIG y describiremos cada uno de ellos.
- Organizar e implementar un proyecto SIG4:26
Estudiaremos las distintas fases que debemos seguir a la hora de crear o implementar un proyecto SIG.
- Documental Agencia Espacial Europea. La forma de la tierra12:30
A continuación un Documental creado por la Agencia Europea Espacial que nos muestra el poder de la Fuerza de la Gravedad en la Tierra y el proyecto desarrollado para crear el nuevo modelo sobre el Geoide Terrestre.
- Las Superficies de Referencia y el Datum2:47
Conoceremos cuales son las superficies de referencia y el Datum. Conceptos fundamentales para establecer un sistema de coordenadas o asignar el sistema de referencia a nuestro proyecto.
- Las proyecciones cartográficas y su clasificación5:03
En esta clase conoceremos en que consiste una proyección cartográfica y estudiaremos las distintas formas de clasificarlas.
- Los Sistemas de Coordenadas3:03
Conoceremos qué son y qué tipos de sistemas de coordenadas existe. Cómo es cada uno y su utilidad.
- Qué es un Sistema de Referencia (CRS)1:30
En esta clase conoceremos que es un Sistema de Referencia (CRS), de sus componentes y como están regulados.
- Formatos de la Información Geográfica: Formato raster y vectorial5:17
En esta clase conoceremos los formatos o modelos utilizados para representar la realidad dentro de un SIG.
- Los análisis espaciales3:11
En esta clase definiremos que es un análisis espacial y hablaremos de su importancia.
- Tipos de Análisis Espaciales6:07
Hablaremos sobre los distintos tipos de análisis espaciales que podemos encontrar dentro de los programas SIG, estudiaremos una clasificación y que pueden hacer cada uno de ellos.
- Autoevaluación: Nociones básicas de los SIG que todos deberíamos conocer
- ArcGIS, mucho más que un programa1:40
En esta unidad realizaremos una introducción a esta sección. ¿Sabías que ArcGIS es mucho más que un programa? y que lo que conocemos cómo ArcGIS es simplemente el software para PC. ¿Sábias que el proyecto ArcGIS contiene páginas web con extensiones que te permiten personalizar tu programa?, ¿Conocer ejemplos de proyectos y aplicaciones de los SIG? y mucho más.
- Manual de la unidad 2. Descarga de Ebook0:05
En esta clase encontraremos el Ebook de la sección disponible para su descarga.
- ArcGIS Desktop. Versiones del programa e instalación6:57
En esta clase conoceremos las distintas versiones del programa ArcGIS for Desktop y mostraremos el procedimiento de instalación.
- Las extensiones de ArcGIS. ¿Cómo ampliar las utilidades de nuestro programa?3:03
En esta clase conoceremos como ampliar las utilidades del programa ArcGIS for desktop por medio de las extensiones. Como ejemplo, descargaremos e instalaremos la extensión del editor para la cartografía del proyecto open street map.
- Bibliografía complementaria0:05
En esta clase encontraremos los recursos bibliográficos complementarios relativos a esta unidad.
- ArcGIS Desktop y sus aplicaciones5:26
En esta unidad conoceremos las aplicaciones que conforman el paquete ArcGIS for Desktop, en específico: ArcCatalog, ArcMap, ModelBuilder y ArcToolbox. Estudiaremos como acceder a ellas y haremos una breve introducción a sus funciones y utilidades, ya que, en las siguientes unidades, estudiaremos como trabajar con cada una de ellas y sus herramientas.
- Autoevaluación: El proyecto ArcGIS
- La importancia de organizar los datos espaciales2:40
En esta clase conoceremos algunas razones de por qué debemos organizar correctamente nuestros archivos geográficas y hablaremos del método de gestión y organización basado en 3 niveles.
- Manual de la unidad 3. Descarga de Ebook y capas para práctica0:07
Aquí encontraremos disponible para su descarga el manual de la unidad y una serie de capas o información geográfica para realizar los procedimientos que estudiaremos en la unidad dentro de nuestro PC
- Formatos de archivos que almacenan información geográfica4:29
Hablaremos de la importancia de conocer los distintos tipos de archivos que almacenan información espacial y las características de cada uno de ellos.
- El catálogo digital. Operaciones básicas5:16
En esta clase conoceremos como utilizar las distintas herramientas que nos permitirán organizar la información geográfica en nuestro disco duro con el fin de evitar duplicados, pérdida de información o simplemente localizar y recuperar rápidamente la información.
- Asignando el sistema de referencia espacial a nuestros datos2:08
En este caso conoceremos las distintas formas posibles para asignar el Sistema de Referencia a nuestra información.
- Autoevaluación: Organizar la información geográfica
- Distintos medios para obtener información geográfica y otros datos3:53
En este caso conoceremos los distintos medios para obtener información geográfica, ya sea utilizando los servicios de ArcGIS (ArcIMS) o información de otros organismos o servidores. También conoceremos que debemos tener en cuenta a la hora de utilizar información creada por otras personas, organismos, etc. externos a nosotros o nuestro equipo de trabajo.
- Manual de la unidad 4: Descarga Ebook0:05
Descarga del manual de la unidad sobre Bases de datos de Biodiversidad y fuentes de información geográfica
- Los servicios ArcIMS: ArcGIS online y ArcGIS base map3:37
En este caso veremos que son los servicios ArcIMS, que tipo de información podemos encontrar y como obtenerla.
- Conectar a IDE4:02
Conoceremos el procedimiento para acceder o conectar a los distintos tipos de servidores IDE y acceder a la información utilizando el programa arcGIS.
- Datos de biodiversidad I: GBIF4:44
En este caso, conoceremos el proceso para obtener datos de ocurrencia de la base de datos internacional del GBIF.
- Datos de Biodiversidad II: VertNet2:32
En esta clase conoceremos otra base de datos sobre Biodiversidad, en específico, esta base de datos se especializa en datos sobre Vertebrados.
- Datos climaticos I: WorldClim2:47
Conoceremos como obtener desde la página web del proyecto WorldClim las capas sobre variables climáticas utilizadas en muchos estudios para calibra Modelos de Distribución de Especies.
- Datos Climaticos II: EcoClimate2:10
En este caso conoceremos EcoClimate, otra fuente de información que nos proporciona capas sobre variables climáticas para la calibración de modelos de distribución de especies.
- Información complementaria0:11
En esta clase encontraremos bibliografía complementaria sobre las fuentes de información espacial importantes para el diseño de Modelos de Distribución de Especies y otras fuentes de datos.
- Obtener Información Geográfica
- La información gráfica y tabular en ArcMap0:53
Breve introducción de lo que estudiaremos a continuación.
- Manual de la unidad 5: Descarga Ebook0:05
En esta clase encontraremos el Ebook de la sección disponible para su descarga.
- La interfaz de ArcMap y las herramientas de navegación5:16
En este caso vamos a conocer: Como esta conformada la interfaz de ArcMap y la información que nos aporta. También, veremos el comportamiento del conjunto de herramientas más utilizadas cuando trabajamos con la información gráfica o su edición: Las herramientas de navegación.
- Administrar la información gráfica y su visualización3:54
En este caso conoceremos las distintas funciones para administrar las capas de un proyecto, dentro de ArcMap.
- Preparando la información I: La georreferenciación6:19
Conoceremos que es la georreferenciación y georreferenciaremos y asignaremos el sistema de coordenadas a una imagen raster utilizando ArcMap.
- Preparando la información II: Asignar sistema de coordenadas y medidas2:15
Antes vimos como georreferenciar y asignar un sistema de referencia a una capa raster, ahora, indicaremos las unidades del medida de la vista para poder realizar cálculos y trabajar con las escalas.
- Preparando la información III: Simbología y etiquetado3:47
Estudiaremos como cambiar la simbología y el etiquetado de los elementos de una capa y las distintas opciones que nos permiten crear mapas temáticos sencillos con la información.
- Los datos tabulares en un SIG1:28
En la clases anteriores hemos trabajado con los datos gráficos, a partir de ahora, manejaremos los atributos y es por eso que esta clase la dedicaremos a conocer como se presentan los atributos de los distintos elementos de una capa dentro de una tabla.
- Operaciones básicas con tablas: Campos4:27
En esta clase conoceremos las distintas opciones que nos permite ArcMap para operar con los campos de las tablas de atributos.
- Consultas de atributos y crear nuevas capas con elementos de otras3:23
Conoceremos como realizar selecciones por atributos. También crearemos una neva capa a partir de elementos selecionados para editarlos en las siguientes clases.
- Crear nuevos atributos: Cálculo de geometrías2:06
En esta clase conoceremos como utilizar la calculadora de geometrías para realizar cálculos sencillos y añadir esa información a los elementos de la tabla de atributos. Esta calculadora nos permite calcular: áreas, perímetros, coordenadas, etc
- Calculadora de campos. Crear nuevos datos a partir de otros1:51
Conoceremos la calculadora de campos que nos permitirá crear nuevos datos a partir de datos ya existentes en la tabla. Al contrario de la calculadora anterior, esta nos permitirá realizar operaciones o etiquetados más complejos.
- Importar datos: Crear capa de eventos o mapear puntos2:10
Conoceremos el procedimiento a seguir para crear una capa de eventos o en otras palabras mapear una tabla de puntos de ocurrencia desde una tabla que podemos descargar desde los servidores o webs con información de biodiversidad, por ejemplo: GBIF, VertNet, etc.
- Asignar etiquetas a los elementos1:07
Conoceremos como asignar etiquetas a los elementos de una capa, puede asignarse para visualizar los datos o para la creación de mapas.
- Hiperenlaces2:40
En esta clase conoceremos como crear vínculos para añadir información externa a los distintos elementos de una capa.
- Primeros pasos con ArcMap
- Los análisis espaciales o geoprocesos1:15
Conoceremos en que consisten los geoprocesos y una breve introducción de lo que aprenderemos en esta unidad.
- Manual de la unidad 6: Descarga Ebook0:12
En esta clase, podrás descargar el manual de la unidad o Ebook.
- Análisis Espacial: Zonas Buffer o Anillos Concéntricos7:19
En esta clase conoceremos como realizar el análisis de próximidad vectorial conocido como Buffer y Anillos Concéntricos. A parte, conoceremos toda la teoría detrás de este análisis.
- Análisis Espacial: Clip o Recorte2:35
Conoceremos en que consiste el análisis Clip y como realizarlo en ArcMap.
- Análisis Espacial: Disolver2:01
En este caso conoceremos en que consiste el análisis espacial Disolver y como realizarlo utilizando ArcMap o Arctoolbox.
- Análisis Espacial: Juntar3:05
Estudiaremos en que consiste el geoproceso Juntar y como realizarlo utilizando ArcMap
- Análisis Espacial: Multipart to Singlepart1:40
Estudiaremos los principios teóricos de este análisis así como aplicarlo utilizando Arctoolbox.
- Análisis Espacial: Unión1:54
En esta clase conoceremos los principios teóricos de este geoproceso y la forma de realizarlo por medio del programa ArcMap.
- Análisis Espacial: Borrar1:52
Conoceremos los principios teóricos y como aplicar este geoproceso utilizado para borrar o realizar recortes entre capas.
- Análisis Espacial: Intersectar2:45
Estudiaremos en que consiste y como realizar el análisis espacial Intersectar.
- Análisis Espacial: Identidad2:41
En esta clase conoceremos como opera y en que consiste el Análisis Espacial Identidad.
- Análisis Espacial: Unión Espacial2:09
Conoceremos el Análisis Unión Espacial que nos permitirá unir capas por medio de un atributo común entre los elementos de ambar capas.
- Autoevaluación: Principales análisis espaciales que debemos conocer
- Los Modelos Digitales de Especies y MaxEnt2:24
En esta clase realizaremos una introducción a los Modelos Digitales de Especies y la aplicación que utilizaremos para realizarlos (MaxEnt)
- Manual de la Unidad 7: Descarga de Ebook0:12
En esta clase encontraremos el Ebook de la sección disponible para su descarga.
- Descargar e instalar MaxEnt2:58
Conoceremos los pasos a seguir para descargar y ejecutar la aplicación para la realización de modelos de especies basados en máxima entropía conocido como MaxEnt.
- Preparar los datos de ocurrencia para el programa I7:44
En esta primera parte, empezaremos a preparar nuestros datos de ocurrencia para realizar nuestro modelo en Maxent.
- Preparar los datos de ocurrencia para el programa II5:58
En esta clase terminaremos de preparar nuestra tabla de puntos de ocurrencia para luego ser utilizada en Maxent
- Preparando las capas ambientales: Mascara de Recorte5:58
Conoceremos el procedimiento para crear una máscara y así ajustar a un contorno nuestras variables ambientales
- Preparando las capas ambientales: Exportar para MaxEnt4:23
Terminaremos de preparar las capas ambientales para ser utilizadas dentro de la aplicación MaxEnt
- Crear un Modelo de Distribución de Especies con Maxent6:57
Conoceremos el proceso a seguir para realizar un Modelo Digital de Especies en Maxent.
- Análisis de resultados I: Modelos predictivos de la especie7:32
En esta clase analizaremos la salida gráfica de MaxEnt. En otras palabras, conoceremos en que consisten los mapas predictivos de distribución de especies logísticos, exponenciales y logartmicos que´podemos obtener utilizando la aplicación de MaxEnt
- Análisis de resultados II: Análisis estadísticos8:58
Conoceremos que información nos arrojan los distintos análisis estadísticos de MaxEnt. Para que se utilizan y que información podemos obtener de ellos importante para el análisis de resultados de nuestro estudio.
- Análisis de resultados III: Análisis de contribución y Jacknife6:22
Hablaremos de los análisis de contribución y los gráficos Jacknife que podemos obtener realizando el análisis de nuestros datos en MaxEnt. Esta información nos permitirá conocer que variables ambientales influyen en la distribución de nuestra especie en estudio.
- Análisis de resultados IV: Curvas de respuesta3:22
Hablaremos de las Curvas de Respuesta que obtenemos como resultado al realizar un análisis de MaxEnt. Que información obtenemos y como interpretarlas para entender nuestros mapas predictivos de distribución de especies.
- Midiendo la Biodiversidad. SDMToolbox
- Introducción1:45
Realizaremos una breve introducción a la unidad y como está estructurada.
- Manual de la Unidad 8: Parte 1: Antes de Empezar0:10
En esta clase descargaremos el manual en PDF que nos describe como instalar o agregar al ArcToolbox la caja de Herramientas SDMToolbox y los detalles a considerar para su correcto funcionamiento.
- Instalar las cajas de herramientas para análisis en ArcGIS3:06
En esta clase conoceremos el procedimiento para ampliar nuestras herramientas para análisis en ArcGIS y agregaremos todas las herramientas necesarias para los análisis que realizaremos en las siguientes clases.
- Herramientas comunes de ArcMap en SDM Toolbox16:51
Estudiaremos cuales son las herramientas que nos encontramos en el primer conjunto de análisis al desplegar el SDM Toolbox. Todas estas herramientas son las más comunes a la hora de trabajar con datos de Biodiversidad.
- Manual de la Unidad 8: Parte 2: Herramientas comunes de ArcMap en SDMToolbox0:10
En esta encontrarás el manual que describe las herramientas básicas de ArcMap que se han enlazado dentro de SDMToolbox.
- Análisis para estimar la riqueza y endemicidad con SDM Toolbox2:30
Estudiaremos los análisis sobre Riqueza y Endemicidad que nos permite realizar SDM Toolbox, como se calculan y la información que necesitamos y obtenemos.
- Manual de la Unidad 8: Parte 3: Análisis para medir la Biodiversidad0:19
Aquí podrás descargar el manual dedicado a los Análisis de Biodiversidad y como ejecutarlos en SDMToolbox
- Práctica: Estimar la Riqueza y Endemicidad a partir de Modelos Binarios9:59
- Introducción a los Análisis de Conectividad de paisajes4:36
A continuación analizaremos en que consisten los análisis de conectividad de paisajes de SDMToolbox, su principio teórico y los resultados que obtendremos.
- Manual de la Unidad 8: Parte 4: Conectividad de paisajes0:07
En esta clase podrás descargar en pdf la cuarta parte del manual de la unidad, en este caso dedicada a estudios de conectividad de paisajes.
- Calcular rutas y corredores de bajo coste para la dispersión de una especie5:28
En esta clase calcularemos los corredores y rutas de menor coste así como la matriz de distancias que reflejan el coste acumulado y la distancia de cada ruta. Análisis que corresponden a la caja de Análisis de Conectividad de Paisajes.
- Las herramientas para trabajar con SDM de SDMToolbox16:35
En esta clase conoceremos los principios teoricos y los resultados que obtendremos con las distintas herramientas para trabajar con Modelos de Distribución de Especies que ofrece SDMToolbox. Estas herramientas permiten mejorar nuestra información para un mejor análisis en MaxEnt o realizar una serie de capas o análisis que complementarán nuestros resultados.
- Manual de la Unidad 8: Parte 5: Herramientas Modelos de Distribución de especie0:13
En esta clase podrás descargar en pdf la quinta parte del manual de la unidad, en este caso dedicado a todas las herramientas de SDMToolbox para trabajar y mejorar nuestros Modelos de Distribución de Especies.
- Crear una capa de Fricción4:24
En esta clase conoceremos como realizar una capa de Fricción con SDMToolbox, utilizada como base para muchos análisis, entre ellos los análisis de conectividad de paisajes
- Calcular cambios de dispersión sentido y magnitud de una especie en el futuro6:21
Conoceremos los análisis que nos permiten a partir de modelos binarios de presente y futuro determinar los cambios y el desplazamiento de la distribución de una especie en el tiempo.
- Crear los Archivos Bias para ser utilizados en MaxEnt3:56
En esta clase conoceremos como realizar los archivos Bias de nuestro área de estudio o trabajo, para ser incluidos dentro de MaxEnt y así poder realizar los Modelos Predictivos de Distribución de Especies.
- Determinar el área de distribución viable por medio de Polígono Mínimo Convexo4:25
Determinaremos el área de distribución factible para la especie de estudio utilizando la metodología del Polígono mínimo convexo.
- Combinar archivo bias con el área de distribución factible de la especie.2:41
- Las herramientas básicas de SDMToolbox. En que consiste cada una de ellas15:02
En esta clase y a modo teórico, analizaremos en que consiste cada una de las herramientas básicas de SDMToolbox o que se puede realizar con cada una de ellas. O visto de otro modo, conoceremos que resultados obtendremos con cada uno de ellas.
- Manual de la Unidad 8: Parte 6: Herramientas básicas de SDMToolbox0:18
Aquí encontrarás el Manual dedicado a las Herramientas Básicas de SDMToolbox que explicará en que consisten cada una de ellas y como ejecutarlas dentro de ArcGIS.
- Crear una Tesela Hexagonal ajustada a nuestro área de estudio4:11
En este caso conoceremos como crear teselas hexagonales en formato vectorial, muy utilizadas para representar los resultados.
- Convertir Modelos contínuos de distribución de una especie a Modelos Binarios2:57
Conoceremos como crear modelos de distribución de especies binarios o de presencia/ausencia a partir de los modelos contínuos que arroja MaxEnt como resultado
- Midiendo la Biodiversidad. SDMToolbox
- Qué es Model Builder1:45
Una breve introducción a la aplicación y lo que realizaremos en esta unidad
- Manual de la Unidad 9: Descarga Ebook0:06
En esta clase encontrarás el manual de la unidad y las capas necesarias para realizar el ejercicio
- Pasos previos para crear un Modelo de Flujo3:33
Prepararemos todo lo necesario para crear un Modelo de Flujo, desde la información ambiental hasta la caja de herramientas personalizada para alojar el modelo
- Diseño del Modelo de Flujo4:25
En esta clase crearemos el Modelo de Flujo, agregaremos y editaremos todas las capas y geoprocesos involucrados.
- Ejecutar un Modelo de Flujo2:26
En esta clase Ejecutaremos el modelo de flujo con el fin de crear la nueva información espacial
- Autoevaluación: Estableciendo metodologías. Model Builder
Requirements
- Se recomiendan conocimientos básicos de Ecología y SIG. No obstante en los manuales encontrarás un gran contenido que explica los principios y conceptos básicos.
Description
En este curso empezaremos desde cero, conoceremos los principios básicos para operar con la información geográfica, llevar a cabo un proyecto SIG y manejar ArcGIS y MaxENT.
Además estudiaremos distintas fuentes que proporcionan información sobre Biodiversidad y variables ambientales, requeridas para realizar los Modelos de Distribución de Especies. A parte de otras fuentes de información geográfica que ofrece ArcGIS y que nos facilitarán el trabajo a la hora de presentar nuestra información o resultados.
También, dedicaremos un espacio para conocer los principales geoprocesos y herramientas que nos permiten operar, analizar y crear nueva información, raster y vectorial. Y analizaremos y conoceremos como trabajar con la aplicación ArcCatalog, que es el módulo de ArcGIS que facilita organizar y administrar la información geográfica de cada proyecto SIG.
Crearemos Modelos de Distribución de Especies (SDMs) por medio de MaxENT, que nos servirán de base, para realizar otra serie de análisis que incluiremos dentro del ArcToolbox de ArcGIS, como análisis de endemicidad, riqueza o conectividad de paisajes.
Conoceremos el módulo de ArcGIS conocido como Model Builder que nos permitirá diseñar metodologías SIG por medio de cadenas de geoprocesos y herramientas, como compartir estos análisis para otros usuarios o guardarlo para aplicarlos a otras áreas de estudio.
Finalmente, estudiaremos las herramientas de ArcMap disponibles para crear y compartir nuestros resultado por medio de mapas.
Who this course is for:
- Estudiantes y profesionales en ecología, medio ambiente, biología y áreas relacionadas.